尽管云计算在企业和普通用户未来的计算需求里占据重要位置，但云计算存在的一切缺点和瑕疵还是在阻碍着企业和组织采用云计算。在云服务交付中扮演重要角色的“网络”也给云计算收益带来了一些新的不确定性和复杂性。而在不同地区的隐私政策和税率也让用户与服务提供商头疼不已。
以下是阻碍云采用的一些主要因素：
企业文化冲击。由于领导和做事风格迥异，每个企业都有其独特的文化，如果一个公司在以前的风格是什么事都自己来，拥有完全掌握一切事情的权利，那么当他们突然发现云计算会完全改变这些如工作流程变化等，他们肯定难以适应。
如果企业的管理者以前是从事内部事务管理，然后从事外部事务管理，也会受到同样影响。
失去控制。企业直接失去了对基础设施和IT环境的控制权，取而代之的是需要使用服务供应商提供的工具来实现交互操作。而企业里具备这些操作的必要技能的人却很少，因此企业需要花费一定的时间来学习。而且操作的权限还受制于服务提供商。
数据安全。有别于本地系统，云计算通过网络访问，显然，如果是其他非法访问也有可能。而本地系统却可以按照企业组织的意愿充分加强安全性，甚至完全切断和外界的链接。此外，在公共网络上的数据传输安全性也越来越受到质疑，许多人认为这种在线传输完全不安全，第三方的窃听者很可能会非法收集数据。而企业组织也完全不知道会是谁以及会在什么时候来窃取数据。
隐私顾虑。如果第三方非法者持有了你的部分数据，那也很难说他们是否已经拥有了你全部的数据。
缺乏标准化规定。由于缺乏标准化协议，不同的云服务提供商在部署自己的系统时可能采用着互不相同的标准，服务之间缺乏兼容性，这将在整个行业造成巨大的混乱，对于用户来说也无法实现很好的互通性操作。这就严重阻碍着云计算的整体发展。
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